困扰农村信用社体制改革的障碍主要有：
　　1、股权结构多样化且股金具有不稳定性，从而导致农村信用社法人治理结构无法得到真正的确立。
　　2、内控制度薄弱，“三会”制度形同虚设，农村信用社经营管理过程中表现出的经营风险多半是由于内控制度不健全或内控制度执行不力的原因所形成的操作风险。
　　3、自身抵御风险能力差，一是长期股权得不到落实，多年经营过程中一直未形成战略投资股；二是资本充足率低；三是多年经营亏损，资金积累不足，导致农村信用社风险抵御能力差。
　　4、行政干预制约了经营和发展，桎梏了农村信用社的自主经营和自我发展。
　　5、员工年龄结构老化、文化素质较低，业务创新和开拓能力明显不足。
　　6、“官办银行”思想仍困扰农村信用社，难以实现现有经营机制的有效转变，农村信用社不能真正走向市场，实现“自主经营、自负盈亏、自担风险“。

　　推进农村信用社体制改革建议：
　　1、引入战略投资者，实现农村信用社法人治理结构有效形成。在目前的改制过程中把引入战略投资者作为第一步改革的目标对农村信用社法人治理结构的形成具有重要的意义。
　　2、把体制改革和人才竞争机制的形成有机结合起来。农村信用社体制改革作为政策性十分强的一项改革任务，在体制改革的同时应打破原有的用工制度，引入人才竞争机制，实现用人机制的社会化，从而为农村信用社体制改革和发展注入新的血液和活力。应从社会上公开招聘高学历、高素质、高技能的年轻人来充实岗位，全面提高员工的综合素质。
　　3、体制改革必须建立相关的配套改革作支撑。农村信用社体制改革涉及到“三农”服务和“三农”的利益，其经营风险伴随着农业经营风险而存在，所以必须确立农村信用社服务“三农”的政策补偿机制，建立农业保险机制，从而确保农村信用社体制改革成果的巩固。
　　4、加大改革的宣传力度，提高员工和社员对农村信用社体制改革的认识。
　　5、建立完善的内控机制。参照《商业银行内部控制指引》，搞好农信社内部控制机制的完善，在落实和执行上需要依靠内部监管和部门之间的权力制衡。
　　6、建立社会监督机制。如信息披露制度，充分接受来自社会、媒体、社员、股东的监督，减弱内部人控制；在强化监管部门行政监管的同时，建立农信社第三方审计制度，每年接受一次来自第三方的独立的外部审计，并注意防止外部监督内部化。
    （作者单位：中国人民银行）