为确保“平安奥运”目标的实现，海淀区卫生局成立了奥运领导指挥机构，建立了8个分工明确、运转顺畅、协作有力的工作体系，从奥运场馆内外的公共卫生安全保障、奥运场馆内突发公共卫生事件等方面，全面做好了奥运保障的各项准备工作。
　　海淀区卫生局在奥运会期间，将承担起竞赛场馆7处共8个；训练场馆8处共22个；非竞赛场馆3处；接待驻地23个；供餐单位约为10处21家；外围保障：上述场馆和驻地外围，另外还有政治敏感部位5处，开放赛事比赛路线2条，奥运途径路线20条，定点医院4个，环境建设重点大街30条、重点区域6处的公共卫生安全保障。
　　为确保“平安奥运”目标的实现，海淀区卫生局成立了奥运领导指挥机构，建立起了集奥运保障协调、效能稽查、后勤保障、法制稽查和信息宣传、场馆内公共卫生保障组和城市运行公共卫生保障8个分工明确、运转顺畅、协作有力的工作体系，从奥运场馆内外的公共卫生安全保障、奥运场馆内突发公共卫生事件等方面，全面做好了奥运保障的各项准备工作。
　　抓好奥运场馆内外两条线
　　海淀区卫生局分别成立了奥运会场馆内公共卫生保障团队及城市运行公共卫生保障组，全力以赴做好奥运及残奥会做好各项卫生保障工作。
　　针对奥运会场馆(群)，海淀区组建了19支奥运会场馆(群)内公共卫生保障团队，构建辖区奥运场馆内公共卫生安全保障体系。在重点开展奥运场馆内相关保障工作的培训和保障方案的具体落实中，对海淀区奥运场馆和训练馆进行了卫生保障工作督导检查。
　　城市运行卫生保障组主要承担了海淀区奥运场馆安保线以外区域的公共卫生保障工作，工作内容涉及卫生监督、疾病预防与控制、爱国卫生、医疗等。海淀区城市运行公共卫生保障组下设10个分组，各保障小组按照职责分工已经于7月1日起，全部进入奥运运行阶段；7月14日，前来支援海淀区的101名外地卫生监督员在进行统一组织强化培训后，也安排到岗。目前，城市运行公共卫生保障组已经完成20条餐饮消费放心街；辖区内签约酒店、奥运送餐企业、奥运属地参观服务商A级标准认定工作已基本达到全市要求，海淀全区消灭了量化分级D级单位。此外，海淀区还加强了游泳场馆专项检查及管水人员培训工作、集中空调通风系统清洗专项工作。
　　加强病媒生物防控和疾病预防
　　为全力做好奥运会病媒生物防控工作，海淀区组织了3次海淀全区范围的病媒控制消杀工作，对重点区域施药，对500家重点公共场所进行检查督导。区爱卫办制定出了“2008年海淀区奥运会及残奥会病媒生物应急防治预案”，对辖区22个街道、7个乡镇的外环境卫生进行治理，并开展了“整治环境、创清洁家园”的清洁月活动，对机关、学校、托儿所、医疗机构、农贸市场、餐饮、宾馆饭店、社区、平房区等100余个被检单位进行了为期20天的卫生大检查活动，完成了全市统一灭鼠、统一病媒生物防控投药消杀的工作。
　　同时，海淀区开展了大量的流动人口调查和疾病预防工作，通过组织各街道、乡镇和医疗机构开展了外来务工人员免费接种麻疹、A+C群流脑疫苗，学龄前外来儿童强化查漏补种工作，积极推进免疫预防规范化门诊及基层预防接种门诊信息化建设工作；继续加强艾滋病、结核病防治工作，大力推广安全套进客房，为近80家宾馆免费下发安全套2万个，宣传画300张，预防控制艾滋病读本2.5万册；继续开展流感、禽流感等传染病的监测工作；多部门联动防治手足口病。
　　强化应急反应能力
　　针对突发公共卫生事件，海淀区组建了传染病疫情、预防接种和预防服药群体性不良反应事件以及群体性不明原因疾病事件专家评估委员会，为有效开展突发公共卫生事件的调查、处置、救治迅速、有效地予以处理提供有力的组织保障、必要的技术保障。
　　海淀区还专门成立了由专业人员组成的公共卫生保障团队，组建了由区疾病预防控制、卫生监督以及医疗救援三部分组成的应急队紧急医疗救治保障团队，制定了奥运会与残奥会场馆内公共卫生保障工作方案及城市运行公共卫生保障方案，开展了应急预案和专业知识的培训学习，并进行了20余次以食物中毒、肠道传染病防控、生物反恐怖为重点的应急演练及桌面演练，使应急队员们为处理突发公共卫生事件做好了应急准备；海淀区还专门做好了药品、疫苗、医疗器械、快速检验检测技术和试剂、卫生防护用品等应急物资和设施的储备，并在海淀区“120”院前急救系统又新增13个急救站点。应急部门还建立了与公安部门联动力的报警和突发事件处置工作机制。